История архивов в Якутии берет свое начало с середины XVII в., когда в 1641 г. в Ленский (Якутский) острог прибыли первые якутские воеводы – П.П. Головин и М.Б. Глебов, а вместе с ними дьяки, подьячии, письменные головы – первые делопроизводители.
В фондах архива отложились документы партийных и комсомольских организаций, общественных организаций и документы новейшей истории, которые хранятся в корпусе №2 по ул. Кирова, 14.
Успешно продолжаются заложенные усилиями нескольких поколений архивистов, традиции публикаторской деятельности. Архивом совместно с его бывшим филиалом и другими научными учреждениями издано более 100 сборников документов, брошюр, буклетов, фотоальбомов. С 2000 г. возобновлено издание журнала «Якутский архив».