Исследована изменчивость участка гена цитохрома b ( cyt b ) митохондриальной ДНК длиной 744 пары нуклеотидов 13 образцов восточноазиатских мышей Apodemus peninsulae из популяции Национального парка «Земля леопарда» на юге Приморского края.
Показано присутствие двух филогенетических линий в этой популяции:«Amur» и «Korea». При этом линия «Korea» была обнаружена для Дальнего Востока России впервые. Обсуждается вопрос согласованности эволюции хантавируса AMRV и его природного носителя - восточноазиатской мыши.
Идентификаторы и классификаторы
Сравнение картин филогеографии инфекционных агентов и их хозяев является важным для решения экологических, эволюционных и прикладных вопросов.
Подобные исследования могут облегчить обнаружение скрытых линий как у вирусов, так и у их хозяев, а также помочь в прогнозировании распространения инфекций.
В настоящей работе нами рассмотрен комплекс паразит–хозяин: хантавирус AMRV — восточноазиатская мышь Apodemus peninsulae.
Список литературы
-
Громов, И. М., Ербаева, М. А. (1995) Млекопитающие фауны России и сопредельных территорий. Зайцеобразные и грызуны. СПб.: ЗИН РАН, 522 с.
-
Костенко, В. А. (2000) Грызуны (Rodentia) Дальнего Востока России. Владивосток: Дальнаука, 210 с.
-
Подгорная, О. И., Галактионов, Н. К. (2009) Мобильные элементы как потенциальные векторы горизонтального переноса генетической информации в системах паразит-хозяин. Труды Зоологического института РАН, т. 313, № 3, с. 283-296. DOI: 10.31610/trudyzin/2009.313.3.283 EDN: KWOWQZ
-
Потт, А. Б., Компанец, Г. Г. (2017) Изучение вирулентности штаммов геноварианта Amur ортохантавируса Hantaan. Здоровье. Медицинская экология. Наука, т. 72, № 5, с. 82-86. DOI: 10.5281/zenodo.1115481 EDN: YNHYZS
-
Савицкая, Т. А., Иванова, А. В., Исаева, Г. Ш. и др. (2021) Обзор хантавирусных инфекций в мире, эпидемиологической ситуации по геморрагической лихорадке с почечным синдромом в Российской Федерации в 2020 г. и прогноз на 2021 г. Проблемы особо опасных инфекций, № 2, с. 62-70. DOI: 10.21055/0370-1069-2021-2-62-70 EDN: VGQEDZ
-
Синюгина, А. А., Дзагурова, Т. К., Ишмухаметов, А. А. и др. (2019) Доклинические исследования поливалентной вакцины против геморрагической лихорадки с почечным синдромом. Эпидемиология и Bакцинопрофилактика, т. 18, № 4, с. 52-58. DOI: 10.31631/2073-3046-2019-18-4-52-58
-
Ткаченко, Е. А., Бернштейн, А. Д., Дзагурова, Т. К. и др. (2005) Сравнительный анализ эпидемических вспышек геморрагической лихорадки с почечным синдромом, вызванных вирусами Пуумала и Добрава/Белград. Эпидемиология и вакцинопрофилактика, № 4, с. 28-34. EDN: KZPWBV
-
Шереметьева, И. Н., Цуканова, В. Д., Тимофеева, Д. М. и др. (2020) Новые данные по распределению основных филогенетических линий восточноазиатской мыши Apodemus peninsulae на востоке России. Региональные проблемы, т. 23, № 3, с. 10-20. EDN: ZTIILC
-
Яшина, Л. Н. (2012) Генетическое разнообразие хантавирусов в популяциях грызунов и насекомоядных Азиатской части России. Автореферат диссертации на соискание ученой степени доктора биологических наук. Новосибирск, Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии “Вектор”, 50 с. EDN: QFOECX
-
Яшина, Л. Н., Сметанникова, Н. А., Компанец, Г. Г. и др. (2019) Молекулярная эпидемиология патогенных хантавирусов на Дальнем Востоке России, 2015-2018 гг. Проблемы особо опасных инфекций, № 4, с. 102-108. DOI: 10.21055/0370-1069-2019-4-102-108 EDN: CNOOAJ -
Aljanabi, S. M., Martinez, I. (1997) Universal and rapid salt-extraction of high quality genomic DNA for PCR-based techniques. Nucleic Acids Research, vol. 25, no. 22, pp. 4692-4693. DOI: 10.1093/nar/25.22.4692 EDN: IUUGAZ -
Bayarlkhagva, M., Tumendemberel, O., Bayarlkhagva, D. (2013) Mitochondrial cytochrome b gene study of Apodemus peninsulae in Mongolia.International Journal of Current Research, vol. 5, no. 12, pp. 3892-3896. DOI: 10.13140/RG.2.2.24365.31200 -
Bennett, S. N., Gu, S. H., Kang, H. J. et al. (2014) Reconstructing the evolutionary origins and phylogeography of hantaviruses. Trends in Microbiology, vol. 22, no. 8, pp. 473-482. DOI: 10.1016/j.tim.2014.04.008 EDN: UQBEKN -
Hall, T. A. (1999) BioEdit: A user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Nucleic Acids Symposium Series, vol. 41, pp. 95-98. -
Hasegawa, M., Kishino, H., Yano, T. (1985) Dating the human-ape splitting by a molecular clock of mitochondrial DNA. Journal of Molecular Evolution, vol. 22, pp. 160-174. DOI: 10.1007/BF02101694 EDN: PORQPO -
Jonsson, C. B., Figueiredo, L. T. M., Vapalahti, O. (2010) A global perspective on hantavirus ecology, epidemiology, and disease. Clinical Microbiology Reviews, vol. 23, no. 2, pp. 412-441. DOI: 10.1128/CMR.00062-09 EDN: MYDGXV -
Kariwa, H., Yoshimatsu, K., Arikawa, J. (2007) Hantavirus infection in East Asia.Comparative Immunology, Microbiology, Infectious Diseases, vol. 30, no. 5-6, pp. 341-356. DOI: 10.1016/j.cimid.2007.05.011 EDN: MENMXF -
Kim, H. R., Park, Y. C. (2011) The complete mitochondrial genome of the Korean field mouse Apodemus peninsulae (Rodentia, Murinae) from Korea. Mitochondrial DNA, vol. 22, nо. 4, pp. 97-98. DOI: 10.3109/19401736.2011.624610 -
Kumar, S., Stecher, G., Li, M. et al. (2018) MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across Computing Platforms. Molecular Biology and Evolution, vol. 35, no. 6, pp. 1547-1549. DOI: 10.1093/molbev/msy096 -
Liu, S.-Y., He, K., Chen, S. D. et al. (2018) How many species of Apodemus and Rattus occur in China? A survey based on mitochondrial cyt b and morphological analyses. Zoological Research, vol. 39, nо. 5, pp. 309-320. DOI: 10.24272/j.issn.2095-8137.2018.053 -
Liu, X., Wei, F., Li, M. et al (2004) Molecular phylogeny and taxonomy of wood mice (genus Apodemus Kaup, 1829) based on complete mtDNA cytochrome b sequences, with emphasis on Chinese species. Molecular Phylogenetics and Evolution, vol. 33, nо. 1, pp. 1-15. DOI: 10.1016/j.ympev.2004.05.011 EDN: MDVJPJ -
Sakka, H., Quéré, J. P., Kartavtseva, I. V. et al. (2010) Comparative phylogeography of four Apodemus species (Mammalia: Rodentia) in the Asian Far East: evidence of Quaternary climatic changes in their genetic structure. Biological Journal of the Linnean Society, vol. 100, no. 4, pp. 797-821. DOI: 10.1111/j.1095-8312.2010.01477.x EDN: MXNRNV -
Schmaljohn, C. (2009) Vaccines for hantaviruses. Vaccine, vol. 27, suppl. 5, pp. D61-D64. DOI: 10.1016/j.vaccine.2009.07.096 EDN: ONMVUT -
Serizawa, K., Suzuki, H., Iwasa, M. A. et al. (2002) A spatial aspect on mitochondrial DNA genealogy in Apodemus peninsulae from East Asia. Biochemical Genetics, vol. 40, no. 5-6, pp. 149-161. https://doi.org/10.1023/a:1015841. EDN: LHIRBF -
Yashina, L. N., Mishin, V. P., Zdanovskaya, N. et al. (2001) A newly discovered variant of a hantavirus in Apodemus peninsulae, Far Eastern Russia. Emerging Infectious Diseases, vol. 7, no. 5, pp. 912-913. DOI: 10.3201/eid0705.017530 EDN: LGXFMH -
Yashina, L. N., Patrushev, N. A., Ivanov, L. I. et al. (2000) Genetic diversity of hantaviruses associated with hemorrhagic fever with renal syndrome in the Far East of Russia. Virus Research, vol. 70, no. 1-2, pp. 31-44. DOI: 10.1016/s0168-1702(00)00203-3 EDN: LGHYRT -
Zhang, Y.-Z., Zou, Y., Yao, L.-S. et al. (2007) Isolation and characterization of hantaviruses carried by Apodemus peninsulae in Jilin, China. Journal of General Virology, vol. 88, no. 4, pp. 1295-1301. DOI: 10.1099/vir.0.82534-0 EDN: MENMWV
Выпуск
Другие статьи выпуска
Чайка Кумлиена - подвид полярной чайки Larus glaucoides kumlieni Brewster, 1883, гнездящийся в основном в южной части о. Баффинова Земля и зимующий на северо-востоке Канады и США. В Азии эту чайку регистрировали на зимовке в Японии и Южной Корее, но не было ни одной достоверной находки ее на территории России.
В данном сообщении приводится информация о первом документированном наблюдении чайки Кумлиена в северо-восточной части Охотского моря, где 2 марта 2020 г. сфотографировали взрослую особь в зимнем наряде в координатах 57°03′00″N, 153°23′10″E в 170 км от побережья Западной Камчатки.
Анализ описательных диагностических признаков в сравнении с близкородственными формами glaucoides и thayeri показал, что все они соответствуют L. g. kumlieni . Достоверность идентификации подтверждена Фаунистической комиссией при Мензбировском орнитологическом обществе.
Приводятся данные о возрастной структуре и половом диморфизме дальневосточной жабы, Bufo sachalinensis Nikolsky, 1905 на территории Уссурийского государственного природного заповедника. Всего были изучены препараты от 53 животных (22 самок и 31 самца).
Возраст изученных самок колебался от 4 до 7 лет, в среднем 5,2±0,97, самцов - от 2 до 6 лет, в среднем 3,9±1,00. Средняя длина тела самок статистически значимо превосходила длину самцов.
Отмечается наличие дополнительных линий склеивания, соответствующих периодам задержки роста в летний период. Мы не выявили положительной корреляции между возрастом и размерами тела.
Изучение врожденного иммунитета моллюсков необходимо для понимания эволюции иммунной системы и разработки стратегии борьбы с их паразитами.
В данной работе впервые получен и проанализирован транскриптом гемоцитов моллюсков Planorbarius corneus , зараженных в естественных условиях трематодой Bilharziella polonica (Schistosomatidae).
В сборках обнаружены транскрипты, кодирующие все основные группы факторов врождённого иммунитета. Наиболее многочисленной группой оказались молекулы распознавания патогенов.
На основе нуклеотидных последовательностей транскриптов предсказана доменная структура кодируемых ими белков.
Проанализирована структура доменов лектинов, толл-подобных рецепторов, молекул адгезии и токсинов. Показано большое разнообразие патоген-распознающих молекул гемоцитов P. corneus.
Полученные данные расширяют знания об иммунных реакцияхлегочных моллюсков на трематодную инвазию и дают возможность рассматривать роговую катушку как новый модельный организм для изучения их защитных реакций.
В статье приводится новая находка Phytometra amata (Butler, 1879) из Алтайского края. Вид впервые указывается для фауны Западной Сибири, для Русского Алтая и Предалтайского региона Каталога чешуекрылых России. Граница сибирской части ареала вида расширена почти на 500 км на юго-запад.
Приводится список совкообразных чешуекрылых (Noctuoidea), встреченных в месте поимки Phytometra amata . Рассматриваются биотопические предпочтения имаго и вероятные трофические связи гусениц Phytometra amata в Алтайском крае.
Сведения о трематодах рыб Мингечевирского водохранилища практически отсутствовали. Паразитологические исследования 341 экз. рыб, относящихся к 25 видам, проведенные в 2016-2022 гг. в этом водоеме выявили 26 видов трематод.
Из них 9 видов завершают свое развитие в рыбах, а 17 видов - в рыбоядных птицах. Отмечена зависимость фауны трематод различных трофических групп рыб от состава их пищи.
Фауна трематод рыб была богаче на участках, расположенных у устьев рек, впадающих в водохранилище, а также в меньшей степени на участке у места выхода реки Куры из водохранилища.
На участках, расположенных далеко от этих мест, фауна трематод сильно обеднена. Среди всех отмеченных трематод восемь видов являются возбудителями болезней рыб, а один вид опасен для человека.
Тарбаган, или монгольский сурок Юго-Восточного Забайкалья внесен в Красную книгу России. В 2012-2023 гг. проводились ежегодные учёты этого вида на двух федеральных особо охраняемых природных территориях: в Даурском заповеднике и в заказнике «Долина дзерена», расположенных в России вдоль границы с Монголией и Китаем.
В начале 2023 года численность сурков составляла около 3110 семей в заказнике и около 310 семей в Даурском заповеднике (вместе с охранной зоной). Отмечено, что скорость восстановления численности в отдельных колониях после ее снижения может достигать 26% в год, но при освоении новой территории рост численности популяции составил всего около 12% в год.
Низкая скорость роста популяции по сравнению с потенциально возможной может быть связана с высоким уровнем смертности от хищников и низким реализованным уровнем воспроизводства.
Общая численность тарбагана на двух рассматриваемых особо охраняемых природных территориях весной 2023 г. составляла примерно 9.6 тыс. особей, что сопоставимо с оценкой численности вида в Юго-Восточном Забайкалье в целом по состоянию на 2017-2018 гг.
Согласно современным данным, в фауне заповедника «Большехехцирский» выявлено 54 вида млекопитающих из 18 семейств и 6 отрядов, в числе которых обитание двухцветного кожана, уссурийского трубконоса, пятнистого оленя и канадского бобра в заповеднике установлено в последние десятилетия.
Наименее изученной остается фауна рукокрылых. Наблюдениями, в том числе при помощи фотоловушек, подтверждено обитание харзы и кабарги, длительное время не отмечаемых на этой особо охраняемой природной территории; получены новые сведения о пребывании в заповеднике обыкновенной куторы, уссурийской белозубки, сибирского ушана, длиннохвостой мышовки, амурского тигра и амурского лесного кота; ставится вопрос об исключении солонгоя из списка териофауны заповедника.
Издательство
- Издательство
- РГПУ им. А. И. Герцена
- Регион
- Россия, Санкт-Петербург
- Почтовый адрес
- 191186, Санкт-Петербург, набережная реки Мойки 48
- Юр. адрес
- 191186, Санкт-Петербург, набережная реки Мойки 48
- ФИО
- Тарасов Сергей Валентинович (ректор)
- E-mail адрес
- mail@herzen.spb.ru
- Контактный телефон
- +7 (812) 3124477